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DNA計算機的研究取得最新進展

時間:2011-06-29     來源:中國經(jīng)濟網(wǎng)
來自加州理工學院的研究人員聲稱他們成功的研發(fā)出了世界上最大的以DNA(脫氧核糖核酸)為基礎的計算電路。他們說利用該技術可以很容易地研發(fā)出更為復雜的DNA計算機。這種新技術的研究是由美國國家科學基金會資助的,這是向用標準信息處理技術來控制生物系統(tǒng)進軍的重要一步。 


  在不久的將來,DNA計算機可以執(zhí)行像當今以硅為基礎的普通計算機所做的邏輯計算功能。但DNA計算機可以變得更小,更容易與人體等生物系統(tǒng)結合。例如,生物電路可以直接嵌入在細胞或組織內以用來發(fā)現(xiàn)和治療疾病。 


  加州理工學院的研究人員Erik Winfree和Lulu Qian在6月3日的Science上發(fā)表他們的工作成果。一位杜克大學計算機科學教授John Reif認為,雖然該論文基本上還屬于基礎技術層面,但他們采用的這種方法標志著以DNA為基礎的計算機又取得了重要的進展?!?/p>


  雖然之前已經(jīng)有簡單的DNA計算系統(tǒng),但是這個示范系統(tǒng)比迄今為止其它的原型都要復雜。 


  研究人員組成了130個人工合成的DNA鏈,這些不同的DNA鏈可組建成邏輯電路。利用這些基本原材料,他們創(chuàng)造出了一個由74分子組成的四位電路,它可以完成1到15之間的開方計算?!?/p>


  在他們的研究中,DNA的多層鏈被用來做成生物邏輯門,可以執(zhí)行基本的布爾運算,例如AND(與)、OR(或),甚至可以執(zhí)行類似當今晶體管計算機處理器執(zhí)行的NOR(異或)運算。就像基于硅集成電路一樣,這些分子邏輯門可以產(chǎn)生二元變量:利用“打開”或“關閉”來表示信號,并以此作為輸入的二進制信號。 


  該計算機利用DNA序列的結合和復制來進行計算操作。一種解決方案是預先設計的DNA分子都沉浸在試管中,當它們彼此接觸時可以結合并產(chǎn)生新的DNA分子,反過來可以連接到其它的DNA鏈,由此產(chǎn)生了邏輯鏈。研究人員還開發(fā)出了編譯器,它可以映射用戶操控DNA電路的邏輯運算?!?/p>


  這項工作是繼2006年試驗的延續(xù),當時采用的DNA分子總數(shù)達到了12個。在此后的研究中,研究人員集中解決了讓使用過程中更簡單、更可靠的問題,這些問題的解決也是DNA基礎系統(tǒng)實用化的前提。 


  John Reif認為上述研究人員的研究成果具有許多優(yōu)點,其中之一就是具有簡單可行性:用來進行DNA編碼所需的生化反應是行之有效的,并且整個過程本身也是可擴展的,這意味著它可以作為大型系統(tǒng)一個極為重要的基礎?!?/p>


  John Reif也指出了一些不足之處,其中一個是計算速度:一個邏輯門的執(zhí)行時間在30到60分鐘之間,執(zhí)行一個4位數(shù)的平方根可能需要長達10個小時。 


  然而研究人員認為,這種運算速度慢的問題是可以克服的。Erik Winfree解釋說,如果允許提高濃度并且改進分子成分就可以減少串擾和泄漏可能。上述假設如果確實有效的話運算速度可加快10到100倍。